Tartu Emajõe Kooli hoolekogu on alaliselt tegutsev organ, kelle ülesanne on kooli õpilaste, õpetajate, kooli pidaja, õpilaste vanemate, vilistlaste ja kooli toetavate organisatsioonide ühistegevus õppe ja kasvatuse suunamisel, planeerimisel ja jälgimisel ning õppeks ja kasvatuseks paremate tingimuste loomine. Hoolekogu koosseisu kuuluvad kooli pidaja, õppenõukogu, õpilasesinduse, vanemate, vilistlaste ning kooli toetavate organisatsioonide esindajad.
Hoolekogu koosseis (kinnitatud haridus- ja teadusministri 19.01.2022 käskkirjaga nr 1.1-2/22/20):
| Nimi | Esindatav koostööpartner | E-posti aadress |
| Ülle Veede |
Hoolekogu esimees Toetava organisatsiooni esindaja, Haridus- ja Noorteameti Rajaleidja keskus |
ulle.veede@harno.ee |
| Jane Kaasik | Lapsevanemate esindaja | janekaasik@hot.ee |
| Gerli Kangur | Vilistlaste esindaja | gerlikangur76@gmail.com |
| Riina Kiting | Õppenõukogu esindaja | riina.kiting@tek.tartu.ee |
| Senta Michelson |
Toetava organisatsiooni esindaja, Tartu Puuetega Inimeste Koda |
sentam2002@yahoo.com |
| Tiiu Rahuoja |
Kooli pidaja esindaja, Haridus- ja Teadusministeerium |
tiiu.rahuoja@hm.ee |
| Sten-Erich Virkus | Õpilaste esindaja | stenvirkus2@gmail.com |
Hoolekogu tegevuse aluseks on põhikooli- ja gümnaasiumiseaduslink opens on new page ning haridus- ja teadusministri 03.12.2010 määrus nr 69 "Riigi üldhariduskooli hoolekogu moodustamise kord ja töökordlink opens on new page"